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Alinhamento de seqüências biológicas em arquiteturas com memória distribuída
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Alinhamento de seqüências biológicas em arquiteturas com memória distribuída
Peranconi, Daniela Saccol
Data da Defesa:
2005-03-04
Orientador:
Cavalheiro, Gerson Geraldo Homrich
Resumo:
A utilização de aglomerados de computadores na solução de problemas que demandam grande quantidade de recursos computacionais vem se mostrando uma alternativa interessante. aglomerados são economicamente viáveis e de fácil manutenção, oferecendo poder computacional equivalente ao de supercomputadores. No entanto,
o desenvolvimento de aplicações para este tipo de arquitetura é complexo, uma vez que envolve questões não presentes na programação seqüencial, como a comunicação de dados e a sincronização de tarefas concorrentes, problemas estes que, em geral, são tratados em supercomputadores por pacotes de software especializados. Neste contexto, este trabalho apresenta o desenvolvimento de um mecanismo de suporte à comunicação sobre aglomerados de computadores, focado na exploração desta plataforma de hardware para o processamento de alto desempenho. O mecanismo criado e disponibilizado sob a forma de uma biblioteca de funções em C, é baseado no modelo de Mensagens
Ativas. Sua implementação é realizada na cama
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