Redes neurais artificiais aplicadas na caracterização e predição de regiões promotoras

Orientador(a) (dc.contributor.advisor)Cechin, Adelmo Luis
Lattes Orientador(a) (dc.contributor.advisorLattes)http://lattes.cnpq.br/6026974071792846pt_BR
Autor(a) (dc.contributor.author)Silva, Scheila de Avila ept_BR
Autor(a) Lattes (dc.contributor.authorLattes)http://lattes.cnpq.br/7731423725040717pt_BR
Data de Disponibilização (dc.date.accessioned)2015-03-05T13:57:00Z
dc.date.available (dc.date.available)2015-03-05T13:57:00Z
Data da defesa / Data do evento (dc.date.issued)2007-01-11
Abstract (dc.description.abstract)The promoter region is localized few base pairs before the gene region. It is responsible by initiate the gene expression process, thus, it plays a regulatory role. The study about the gene expression regulation is a great area, since it can assist in the comprehension of complex metabolic network presented by several organisms and, because the difference between two different species is how and when your genes are turn off and turn on than your structure. The computational methods to gene prediction have a good accuracy, but this is not achieved in the promoter prediction. This difficulty occurs because the length of promoter and the degenerate pattern presented, thus the results presented a great number of false positives. This work aims employed Neural Networks to promoter prediction and recognition of Escherichia coli by two approaches: whit the orthogonal codification and stability values of the promoter sequence. For characterization, realize the extraction rules of type if … then. The results in thisen
Resumo (dc.description.resumo)A região promotora é uma seqüência de DNA que localiza-se anteriormente a uma determinada região gênica. Ela é responsável pelo início do processo de transcrição de um gene ou conjunto de genes. Assim, ela também atua como um elemento regulador da expressão gênica. O estudo da regulação da expressão gênica é relevante porque é essencial para a compreensão da maquinária vital dos seres vivos, já que a diferença entre duas espécies está mais relacionada em como e quando seus genes estão “ativos” ou “inativos” do que com a estrutura destes em si. Embora exista métodos computacionais para a predição de genes com boa acurácia, o mesmo não é conseguido para os promotores. Esta dificuldade deve-se ao pequeno e pouco conservado padrão das seqüências, gerando assim resultados com alto número de falsos positivos. Além dos motivos consensuais, os promotores possuem características físicas que os diferem de seqüências não-promotoras. No entanto, estas ainda não são amplamente utilizadas no problema de predição in silicpt_BR
Agência de fomento (dc.description.sponsorship)Nenhumapt_BR
URI (dc.identifier.uri)http://www.repositorio.jesuita.org.br/handle/UNISINOS/2230
Idioma (dc.language)pt_BRpt_BR
Nome da instituição (dc.publisher)Universidade do Vale do Rio do Sinospt_BR
País da Instituição (dc.publisher.country)Brasilpt_BR
Departamento (dc.publisher.department)Escola Politécnicapt_BR
Sigla da Instituição (dc.publisher.initials)UNISINOSpt_BR
Programa (dc.publisher.program)Programa de Pós-Graduação em Computação Aplicadapt_BR
Direitos de acesso ao documento (dc.rights)openAccesspt_BR
Assunto (dc.subject)bioinformáticapt_BR
Assunto (dc.subject)biologia molecularpt_BR
Assunto (dc.subject)computaçãopt_BR
Assunto (dc.subject)genéticapt_BR
Assunto (dc.subject)rede neuralpt_BR
Assunto (dc.subject)rede neural artificialpt_BR
Assunto (dc.subject)neural networken
Assunto (dc.subject)predictionen
Assunto (dc.subject)promoters prokaryoticen
Tema (CNPq) (dc.subject.cnpq)Ciências Exatas e da Terrapt_BR
Título (dc.title)Redes neurais artificiais aplicadas na caracterização e predição de regiões promotoraspt_BR
Tipo de arquivo (dc.type)Dissertaçãopt_BR

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