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DNA Barcoding helping the identification of Brazilian cetaceans
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DNA Barcoding helping the identification of Brazilian cetaceans
Silva, Vanessa Souza
Date:
2019-11-28
xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-contributorAdvisor:
Oliveira, Larissa Rosa de
Abstract:
A Citocromo C Oxidase Subunidade I (COI) é o gene mitocondrial reconhecido como o código de barras do DNA (DNA Barcoding) e utilizado para identificar diferentes espécies animais. No caso dos cetáceos (botos, baleias e golfinhos), o COI pode auxiliar na identificação mais precisa e/ou confirmar a identidade morfológica de espécimes encontrados em estado avançado de decomposição no litoral brasileiro, sem caracteres diagnósticos externos evidentes. Este estudo teve como objetivos testar a eficiência do COI na identificação específica da maioria das 48 espécies de cetáceos ocorrentes na costa brasileira e gerar suas respectivas sequências para depositá-las em bancos de dados públicos de sequências (BrBol, FishBol e GenBank), a fim de subsidiar novos trabalhos por pesquisadores de qualquer parte do mundo. Para tanto, o COI foi amplificado para 152 espécimes coletados por 13 instituições brasileiras e enviadas para análise. A comparação entre as sequências obtidas e as das espécies de cetáceos previamente depositadas no GenBank foi feita pela ferramenta Blast, a qual é baseada na similaridade entre as sequências. Além disso, cada amostra possuía um espécime depositado em coleção científica como material testemunho, o que permitiu sua identificação morfológica a priori. Como resultado, foram obtidas 152 sequências de COI de 33 espécies, as quais representam 70% da fauna dos 47 cetáceos registrados para a costa brasileira. Foram geradas sequências de COI das seguintes espécies: Eubalaena australis (n=5), Balaenoptera acutorostrata (n=4), Balaenoptera bonaerensis (n=2), Balaenoptera brydei (n=5), Balaenoptera physalus (n=1), Megaptera novaeangliae (n=9), Physeter macrocephalus (n=9), Kogia breviceps (n=2), Kogia sima (n=6), Berardius arnuxii (n=1), Mesoplodon europaeus (n=1), Ziphius cavirostris (n=5), Delphinus delphis (n=9), Globicephala melas (n=1), Lagenodelphis hosei (n=7), Peponocephala electra (n=4), Pseudorca crassidens (n=8), Stenella attenuata (n=4), Stenella clymene (n=6), Stenella coeruleoalba (n=5), Stenella frontalis (n=4), Stenella longirostris (n=5), Steno bredanensis (n=4), Tursiops truncatus (n=9), Pontoporia blainvillei (n=12), Inia geoffrensis (n=2), Inia araguaiaensis (n=3). Apenas nos gêneros Stenella e Delphinus o gene COI não foi capaz de identificar suas espécies de maneira consistente, quando comparado com os caracteres anatômicos do material depositado em coleção. Estes resultados sugerem a necessidade da continuidade deste estudo bem como reforça a importância da combinação de caracteres morfológicos e moleculares para identificação de cetáceos.
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