Neste trabalho apresentamos um estudo avaliativo da distribuição dos foraminíferos bentônicos juntamente com análises de parâmetros físico-químicos da Laguna Tramandaí-Armazém, no estado do Rio Grande do Sul (Brasil). A distribuição dos foraminíferosjuntamente com análises de parâmetros físico-químicos da água, sugerem que a dinâmica ambiental na laguna é impulsionada por uma interação de mecanismos naturais e também antropogênicos. Os foraminíferos bentônicos na laguna se apresentam com uma dominância de espécies aglutinantes próximas às margens da laguna, enquanto espécies hialinas calcárias, com preferências por salinidades mais elevadas, dominam na porção central da laguna. As concentrações de metais dissolvidos nas águas da laguna estão dentro dos limites estabelecidos para águas salobras classe 2, destinada a pesca amadora e à recreação de contato secundário, de acordo com as normas brasileiras (CONAMA e CONSEMA) e internacionais. No entanto, o aumento do carbono orgânico, oriundo do aporte fluvial e dos esgotos de cidades próximas, e a oxigenação da água, apresentada pelo pH, interferem na distribuição de foraminíferos na Laguna Tramandaí-Armazém. Embora as assembleias de foraminíferos bentônicos tenham permanecido relativamente estáveis desde a década de 1960, quando foram descritos pela primeira vez na laguna, no presente trabalho registra a primeira ocorrência do gênero Bulimina. Adicionalmente, nossos resultados ressaltam a importância do monitoramento contínuo e dos esforços de conservação na Laguna Tramandaí-Armazém e corpos d'água adjacentes no sul do Brasil.