O teste de detecção de RNA viral, por meio da PCR, apresenta boa especificidade e sensibilidade sendo, desta forma, considerado um método eficiente para diagnóstico precoce em recém-nascidos expostos ao HIV. No entanto, um grande desafio ainda presente é o diagnóstico do HIV em crianças até 18 meses de vida, devido a transferência de anticorpos maternos durante a gestação. Objetivo: Identificar na literatura nacional e internacional, por meio de revisão sistemática, produções que discutam o método da PCR quantitativa no diagnóstico de recém-nascidos expostos ao vírus da imunodeficiência humana. Métodos: Trata-se de uma revisão sistemática das produções científicas nacionais e internacionais, realizada por meio de uma ampla busca eletrônica nas bases de dados LILACS, SciELO, MEDLINE (PUBMED), Science Direct, SCOPUS e Cochrane Library, de 1992 a 2010. Os descritores foram selecionados por palavras-chave e Mesh Terms, sendo estes: carga viral; diagnóstico; AIDS; crianças e suas diferentes combinações, além dos termos infant; HIV infections; diagnosis e viral load, bem como nas suas línguas correspondentes. Os artigos selecionados foram submetidos à avaliação, por meio de escores de qualidade (Owens e col.). Resultados: Foram selecionados efetivamente 13 artigos, realizados em diferentes lugares do mundo dos quais seis foram de coorte, quatro transversais e três clínicos randomizados. A sensibilidade média do método, considerando todas as faixas etárias foi de 76%, com especificidade 95%. Nos estudos que compararam a PCR quantitativa com a PCR qualitativa ou com a cultura viral, a PCR RNA quantitativa foi a que mostrou os melhores resultados na discriminação de crianças portadoras e não portadoras do HIV. Conclusão: A PCR RNA quantitativa se mostrou altamente sensível e específica, podendo ser utilizada em todas as regiões do mundo, não apenas para o monitoramento da progressão da infecção entre adultos e crianças, da resposta aos antirretrovirais, mas também para o diagnóstico da infecção pelo HIV em crianças expostas.